De acordo com as investigações da Polícia Civil, a discussão que culminou no assassinato foi motivada por ciúmes. Em depoimento, Jonatã alegou que a ex-esposa havia iniciado um novo relacionamento e afirmou também ter consumido bebidas alcoólicas e drogas entre a noite de sábado (10) e a manhã de domingo. Durante o desentendimento, ele pegou uma faca e desferiu os golpes contra a vítima.
Após o ataque, familiares e moradores conseguiram imobilizar o agressor até a chegada da Polícia Militar. O suspeito foi amarrado e retirado rapidamente do local pelos agentes para evitar uma tentativa de linchamento. A faca utilizada no crime foi apreendida e encaminhada para perícia.
Jeane Cristina já havia denunciado Jonatã por violência doméstica e contava com uma medida protetiva de urgência expedida pela Justiça. O casal manteve um relacionamento de aproximadamente 16 anos.
O suspeito havia sido preso em julho após agredir a então companheira. Ele permaneceu detido por cerca de dois meses e foi colocado em liberdade em setembro, período após o qual a restrição judicial foi concedida à vítima. Apesar da medida protetiva, Jeane esteve na casa dos ex-sogros para celebrar a data com o filho.
Jonatã de Jesus Batista se apresentava nas redes sociais como pastor itinerante, compartilhando vídeos de cultos e reflexões religiosas. Nove dias antes do crime, ele havia publicado uma mensagem em seus perfis afirmando que pessoas religiosas seriam mais perigosas do que demônios.